苗期主要病害有：猝倒病、立枯病、霜霉病、灰霉病、病毒病、菌核病、疫病等；由環(huán)境因素引起的生理性病害有：凍害、熱害、燒苗、旱害、鹽害、澇害、漚根、有害氣體毒害、藥害等。

病害以預防為主，做好綜合防治，提高幼苗素質(zhì)，控制育苗環(huán)境，及時調(diào)整并杜絕各種傳染途徑，做好育苗器具、種子、工作人員及育苗環(huán)境的消毒，再輔以經(jīng)常檢查，盡早發(fā)現(xiàn)病害，及時進行化學防治。

漂浮蔬菜育苗基質(zhì)在相對較密閉的環(huán)境，一般都安裝有防蟲網(wǎng)，所以出現(xiàn)的蟲害很少，如果出現(xiàn)蟲害要及時使用化學農(nóng)藥進行防治。

一般常用藥劑有：75%百菌清、64%殺毒礬、72%普力可等；嚴禁使用劇毒、高毒農(nóng)藥；出口蔬菜要嚴格按要求使用化學農(nóng)藥，提倡施用生物農(nóng)藥。